Civilizációs fejlődésünk következményeként több millió tonna különböző hulladékot termelünk évente. Így értelemszerűen a hulladékgazdálkodással kapcsolatos tevékenységek körébe tartozik a hulladékok begyűjtése, a biztonságos szállítása és tárolása, valamint az ártalmatlanítása. A Zöldkommandó Szolgálat célja, hogy Magyarország egész területén kontrollálja ezt a folyamatot, vagyis megelőzze, megakadályozza és szankcionálja az illegális hulladékszállítmányokat.

A szúrópróbaszerűen és az előre meghirdetett módon végzett ellenőrzések érintik a Magyarországon áthaladó tranzitszállításokat is. A fokozott ellenőrzések azt a célt szolgálják, hogy sikerüljön megakadályozni az illegális szállítmányok Magyarországon történő lerakását vagy hasznosítását, illetve Európa más területeire történő eljuttatását. A szigor elengedhetetlen a későbbi környezeti károk megakadályozásához.